Vrsta organizacijske strukture, ki jo podjetje izbere, bo vplivala na odnose med zaposlenimi, storitve za stranke in poslovne odnose. Namen organske organizacijske strukture je zagotoviti prožnost za spremembe, ki jih lahko sprožijo zaposleni. Ravni organizacijski model, ki omejuje hierarhijo v organizaciji, je zgrajen okoli misli, potreb in povratnih informacij zaposlenih ali delavcev. Medtem ko organska organizacijska struktura spodbuja demokracijo na delovnem mestu, ima slabosti, ki jih je treba upoštevati.
Brez meja
Člani organizacije določajo meje organske organizacijske strukture. To pomeni, da se lahko pravila, meje in standardi spreminjajo glede na vpliv članov ekipe. To lahko v nekaterih organizacijah deluje dobro, lahko pa povzroči pohlep in sebične motive namesto družbene odgovornosti. Pomanjkanje meja lahko vpliva tudi na odnose s strankami, če ima stranka različne odgovore na isto vprašanje.
Neproduktivne direktive
Ko vodstvo daje direktive, lahko te direktive postanejo neproduktivne zaradi pomanjkanja motivacije. Na primer, če bi bila v lokalni organi kazenskega pregona uvedena organska organizacijska struktura, potreba po nujni in takojšnji usmeritvi ne bi obstajala. V tem primeru je potrebna bolj avtoritativna organizacijska struktura, kjer se podrejeni takoj odzovejo na naročila.
Neučinkovito vodenje
Če je moč v rokah delavca, lahko to vodi do neučinkovitega vodenja. Na primer, če so zaposleni navajeni, da sami upravljajo in nato vodja poskuša uvesti spremembe, se zaposleni morda ne bodo odzvali na to smer, ker se zavedajo, da so vodstvo. Vodstvo v organski organizacijski strukturi mora ostati opredeljeno in aktivno vključeno v proces odločanja in uveljavljanja politike. Ekološka organizacijska struktura lahko tudi odpravi višje vodstvo iz vsakodnevnih poslov podjetja.
Komunikacijske ovire
Organska organizacijska struktura lahko ustvari komunikacijske ovire med oddelki. Ker so oddelki samoupravni, lahko med dvema oddelkoma pride do konfliktov, ki ne vidijo stvari na enak način. Druga komunikacijska ovira je pomanjkanje opredelitve. Če vsak oddelek različno opredeljuje različne politike, en oddelek morda ne razume sporočila, ki ga pošilja drugi oddelek.